Тест 136.
Скелетни дисплазии
Основни характеристики на клиничния фенотип
Скелетните дисплазии, известни още като остеохондродисплазии са хетерогенна група от над 450 заболявания, които водят до аномалии в хрущяли или кости, както и повлияват растежа. Някои скелетни дисплазии се проявяват вътреутробно докато други не се диагностицират до раждането или в по-късна детска възраст. Много скелетни дисплазии са летални преди или в рамките на 6 седмици от раждането, докато други не засягат продължителността на живота. Хората със скелетни дисплазии имат разнообразни симптоми, които могат да включват нисък ръст, асиметричен растеж на костите, нарушена минерализация, увеличена или намалена костна плътност, както и други костни аномалии.
Ултразвуковите или радиологичните находки често са първоначалните индикатори за скелетни дисплазии, но генетичното изследване е от съществено значение за поставянето на окончателната диагноза, която може да подобри клиничните грижи, да подпомогне избора на терапия, да даде информация за фамилния риск.
Анализирането на панел от гени за скелетни дисплазии е особено подходящо, тъй като често клиничните находки са двусмислени и предполагат повече от един тип скелетна дисплазия и е затруднено поставянето на диагноза. Установено е, че 92% от скелетните дисплазии имат генетична компонента.
В панелът са включени гени асоциирани с развитието на следните скелетни дисплазии като изброените по-долу, но и много други:
· Ахондроплазии
· Множествена епифизарна дисплазия и псевдоахондроплазия
· Спондилометафизарна дисплазия и спондило-епи-(мета)-физарна дисплазия
· Хипохондроплазии
· Танатофрона дисплазия
· Остеогенезис имперфекта, други колагенопатии, както и всички дисплазии с понижена костна плътност
· Метафизарна хондродисплазия
· Фронтометафизарна дисплазия
· Брахиолмия
· Кампомелична дисплазия
· Микромелична дисплазия
· Късоребрена дисплазия
· Chondrodysplasia punctata
· Остеопетроза и свързани скелетни дисплазии с повишена костна плътност
· Хипофосфатемичен рахит и свързани скелетни дисплазии с анормална минерализация
· Малформации на крайниците: изолирана брахидактилия, синостози, полидактилия, синдактилия и др
· Краниосиностоза
· Синдром на Seckel,
· 3-M синдром,
· синдром на Рубинщайн-Тайби,
· синдром на Кабуки
Основание за насочване:
Ø Поставена диагноза скелетна дисплазия базирана на пренатални или постнатални клинични индикации
Ø Наличие на засегнати родственици със скелетна дисплазия
Ø Наличие на необясними скелетни аномалии
Ø Наличие на асиметричен растеж на костите
Ø Наличие на чести костни фрактури
Ø Наличие на проблеми с гръбначния стълб
Ø При съмнение за наследствена, генетично обусловена скелетна дисплазия
Провеждането на теста за носителство на мутации в подбрания панел от гени за скелетни дисплазии може да помогне за поставяне и/или потвърждаване на диагноза, което може да даде представа за очакваните симптоми и да допринесе за провеждането на по-персонализирано лечение. Резултатът от генетичният анализ също така дава информация на членовете на семейството за техния риск за развитие на заболяването и позволява провеждането на генетично консултиране и семейно планиране.
Метод: Новогенерационно секвениране (NovaSeq6000, Illumina).
Методът включва двупосочно ДНК секвениране на всички кодиращи екзони и интрон-екзонни граници на прицелните гени. Лабораторията предлага Сангер-секвениране на единичен екзон или двойка екзони при родственици на пациента за определяне на носителския статус в случаите, когато мутацията е известна (Тест №182).
Чувствителност на метода: зависи от съдържанието на GC и АТ, както и от наличието на сегментно дуплицирани гени.
Какво включва тестът?
· Изолиране на ДНК и съхраняване на пробата.
· Новогенерационно секвениране.
· Биоинформатичен анализ на секвенционните данни. За всеки пациент се анализират само данните за гена(ите) от интерес.
· Оформяне на писмен резултат от генетичния тест.
· Диагностична интерпретация на резултатите и генетично консултиране.
Биологичния материал: Венозна кръв, букална лигавица, хорионни въси, абортивен материал или ДНК
За повече информация, моля прочете внимателно „Изисквания към биологичния материал и информация за транспортиране“.
ABCC9, ABL1, ACAN, ACP5, ACTB, ACTG1, ACVR1, ADAMTS10, ADAMTS17, ADAMTSL1, ADAMTSL2, AGA, AGPS, AIFM1, AKT1, ALG12, ALG3, ALG9, ALPL, ALX1, ALX3, ALX4, AMER1, ANKH, ANKRD11, ANO5, ANTXR2, ARHGAP31, ARID1A, ARID1B, ARID2, ARSB, ARSE, ARSL, ASXL1, ASXL2, ATP6V0A2, ATP7A, ATR, B3GALT6, B3GAT3, B4GALT7, B9D1, B9D2, BBOF1, BCS1L, BGN, BHLHA9, BMP1, BMP2, BMP4, BMPER, BMPR1B, BPNT2, BRAF, C2CD3, C3orf22, CA2, CANT1, CASR, CBL, CC2D2A, CCBE1, CCDC8, CCN6, CCNQ, CD96, CDC45, CDC6, CDH3, CDKN1C, CDT1, CENPE, CENPJ, CEP120, CEP152, CEP290, CEP63, CFAP410, CHD7, CHRNG, CHST14, CHST3, CHSY1, CILK1, CKAP2L, CLCN5, CLCN7, COG1, COL10A1, COL11A1, COL11A2, COL1A1, COL1A2, COL2A1, COL3A1, COL5A1, COL5A2, COL9A1, COL9A2, COL9A3, COLEC11, COMP, COPS3, CPLANE1, CREB3L1, CREBBP, CRTAP, CSGALNACT1, CSPP1, CTSA, CTSC, CTSK, CUL7, CYP26B1, CYP27B1, CYP2R1, CYP3A4, DCC, DDR2, DDRGK1, DHCR24, DHCR7, DHODH, DIS3L2, DLL3, DLL4, DLX3, DLX5, DLX6, DMP1, DMRT2, DNA2, DNAH10, DNAJC21, DNMT3A, DOCK6, DONSON, DPF2, DPM1, DVL1, DVL3, DYM, DYNC2H1, DYNC2I1, DYNC2I2, DYNC2LI1, DYNLT2B, EBP, EDN1, EDNRB, EED, EFL1, EFNB1, EFTUD2, EIF2AK3, EIF4A3, ENAM, ENPP1, EOGT, EP300, ERF, ESCO2, EVC, EVC2, EXT1, EXT2, EXTL3, EYA1, EZH2, FAM111A, FAM20A, FAM20C, FAM58A, FAM83H, FANCB, FANCC, FAT4, FBLN1, FBN1, FBN2, FBXW4, FERMT3, FGD1, FGF10, FGF16, FGF23, FGF3, FGF9, FGFR1, FGFR2, FGFR3, FIG4, FKBP10, FKBP14, FLNA, FLNB, FMN1, FN1, FOXC1, FREM1, FUCA1, FUZ, FZD2, GALNS, GALNT3, GDF3, GDF5, GDF6, GH1, GHR, GHRHR, GJA1, GLB1, GLI1, GLI2, GLI3, GMNN, GNAI3, GNAS, GNPAT, GNPTAB, GNPTG, GNS, GORAB, GPC3, GPC4, GPC6, GPX4, GREM1, GSC, GUSB, GZF1, HDAC4, HDAC6, HDAC8, HES7, HESX1, HGSNAT, HNRNPK, HOXA11, HOXA13, HOXD10, HOXD13, HOXD8, HPGD, HRAS, HSPA9, HSPG2, HYAL1, IARS2, ICK, IDH1, IDH2, IDS, IDUA, IFITM5, IFT122, IFT140, IFT172, IFT43, IFT52, IFT57, IFT80, IFT81, IGF1, IGF1R, IGFALS, IHH, IKBKG, IL11RA, IL1RN, IMPAD1, INPPL1, INSR, INTU, IQCE, IRS1, IRX5, JAG1, KAT6A, KAT6B, KDELR2, KDM6A, KIAA0586, KIAA0753, KIAA0825, KIF14, KIF22, KIF24, KIF7, KMT2A, KMT2D, KRAS, LARP7, LBR, LEMD3, LEPRE1, LFNG, LHX3, LHX4, LIFR, LMBR1, LMNA, LMOD3, LMX1B, LONP1, LPIN2, LRP4, LRP5, LRRK1, LTBP2, LTBP3, LZTR1, MAFB, MAN2B1, MANBA, MAP2K1, MAP2K2, MAP3K7, MAPKAPK5, MASP1, MATN3, MBTPS1, MBTPS2, MECOM, MEGF8, MEOX1, MESD, MESP2, MET, MGP, MIR17HG, MKS1, MMP13, MMP14, MMP2, MMP9, MNX1, MPDU1, MSX2, MTAP, MYCN, MYH3, MYO18B, NAA10, NAGLU, NANS, NBAS, NEK1, NEPRO, NEU1, NF1, NFIX, NIN, NIPBL, NKX3-2, NLRP3, NOG, NOTCH1, NOTCH2, NPHP3, NPPC, NPR2, NRAS, NSD1, NSDHL, NTRK1, NXN, OBSL1, OCRL, OFD1, ORC1, ORC4, ORC6, OSTM1, OTX2, P3H1, P4HB, PAM16, PAN2, PAPSS2, PAX3, PCNT, PCYT1A, PDE3A, PDE4D, PEX14, PEX19, PEX5, PEX7, PGM3, PHEX, PHF21A, PHGDH, PIGT, PIGV, PIK3CA, PIK3R1, PISD, PITX1, PITX2, PJA1, PLCB3, PLCB4, PLEKHM1, PLK4, PLOD2, PLS3, POC1A, POLR1A, POLR1C, POLR1D, POP1, POR, POU1F1, PPIB, PRKAR1A, PRKG2, PRMT7, PROP1, PSAT1, PSPH, PTDSS1, PTH1R, PTHLH, PTPN11, PUF60, PYCR1, RAB23, RAB33B, RAC3, RAD21, RAF1, RASA2, RASGRP2, RBBP8, RBM8A, RBPJ, RECQL4, RFT1, RIN1, RIPPLY2, RIT1, RMRP, RNU4ATAC, ROR2, RPA1, RPGRIP1L, RRAS, RSPRY1, RTTN, RUNX2, SALL1, SALL4, SBDS, SCARF2, SEC23A, SEC24D, SEMA3E, SERPINF1, SERPINH1, SETBP1, SETD2, SF3B4, SFRP4, SGMS2, SGSH, SH3BP2, SH3PXD2B, SHH, SHOC2, SHOX, SIX1, SIX5, SKI, SLC10A7, SLC17A5, SLC25A12, SLC26A2, SLC29A3, SLC2A2, SLC34A1, SLC34A3, SLC35D1, SLC39A13, SLC9A3R1, SLCO2A1, SLCO5A1, SMAD3, SMAD4, SMAD6, SMARCA4, SMARCAL1, SMARCB1, SMARCE1, SMC1A, SMC3, SMOC1, SNRPB, SNX10, SOS1, SOST, SOX10, SOX11, SOX2, SOX3, SOX6, SOX9, SP7, SPARC, SPECC1L, SRCAP, SRP54, STAMBP, STAT3, STAT5B, SULF1, SUMF1, TAB2, TALDO1, TAPT1, TBCE, TBX15, TBX19, TBX3, TBX4, TBX5, TBX6, TBXAS1, TCF12, TCIRG1, TCOF1, TCTEX1D2, TCTN2, TCTN3, TENT5A, TERT, TGDS, TGFB1, TGFB2, TGFB3, TGFBR1, TGFBR2, THPO, TMCO1, TMEM107, TMEM165, TMEM185A, TMEM216, TMEM231, TMEM38B, TMEM67, TNFRSF11A, TNFRSF11B, TNFSF11, TONSL, TP63, TRAIP, TRAPPC2, TREM2, TRIM37, TRIP11, TRPS1, TRPV4, TRPV6, TTC21B, TWIST1, TWIST2, TXNL4A, TYROBP, VDR, VIPAS39, VPS33A, WASHC5, WDR19, WDR34, WDR35, WDR60, WISP3, WNT1, WNT10B, WNT3, WNT3A, WNT5A, WNT7A, XRCC4, XYLT1, XYLT2, YY1, YY1AP1, ZEB2, ZFHX2, ZIC1, ZMPSTE24, ZNF141, ZSWIM6
