Тест 143.
Метаболитни заболявания
Основни характеристики на клиничния фенотип
Наследствените метаболитни заболявания са голяма, разнородна група редки заболявания, дължащи са не мутации в единични гени и имащи сходни и припокриващи се симптоми. До този момент са известни над 700 метаболитни заболявания. Представляват редки заболявания, но взети заедно са с честота от 1:800 до 1:2000 новородени. При някои популации с ниска генетична хетерогенност честота на някои метаболитни заболявания може да е и по-висока. Наследствените метаболитни заболявания се характеризират с нарушения на метаболитни пътища и често се проявяват с неврологични симптоми. Дължат се най-често на ензимен дефект или дефицит, което води до акумулиране (натрупване) на субстрати като аминокиселини, въглехидрати и други, в близост до метаболитния блок, дефицит на продукт дистално от блока , или отклоняване на субстрата към алтернативен път и натрупване на токсични метаболити.
Наследствените метаболитни заболявания могат да бъдат класифицирани по различни начини. Най-общо могат да бъдат разделени на нискомолекулни и високомолекулни метаболитни заболявания. Към нискомолекулните метаболитни заболявания спадат аминоацидопатии, нарушения на цикъла на урея, органични ацидемии, нарушения на окисляването на мастни киселини, пуринови и пиримидинови нарушения, нарушения в глюконеогенезата, митохондриални заболявания и нарушения на метаболизма на металите. Към високомолекулните метаболитни заболявания спадат лизозомни болести на натрупването, гликогенови болести, пероксизомни болести и вродени нарушения на гликозилирането.
Голяма част от метаболитните заболявания се унаследяват автозомно рецесивно, но някои се унаследяват Х свързано или автозомно доминантно.
Генетичните изследвания са важни за диагностицирането на метаболитните заболявания, които трудно могат да бъдат диагностицирани чрез биохимични тестове, както и в случаите когато наличността или вида на терапията зависи от конкретния засегнат ген. Ранното откриване, диагностициране и лечение на метаболитните заболявания е от изключителна важност, тъй като много от тях могат да имат тежки дори фатални последици, ако не бъдат лекувани.
Основание за насочване:
Ø Съмнение за наследствено метаболитно заболяване.
Ø Наличие на позитивен резултат от проведен скринингов тест за метаболитни заболявания при новородени
Ø Наличие на неврологични симптоми като енцефелопатия, припадъци в неонаталния период, неонатална хипотония или комбинация от неврологични симптоми през неонаталния период
Ø Наличие на родственик с метаболитно заболяване
Генетичният анализ спомага за диагностицирането, правилното класифициране на метаболитните заболявания и в някои случаи показва какви са възможностите за терапия. Установяването на генетичната причина за възникнало метаболитно заболяване спомага за определянето на вероятността за унаследяване на заболяването в потомството. Също така може да спомогне за откриването на засегнатите родственици, както и тези които са здрави носители.
Метод: Новогенерационно секвениране
Методът включва двупосочно ДНК секвениране на всички кодиращи екзони и интрон-екзонни граници на прицелните гени. Лабораторията предлага Сангер-секвениране на единичен екзон или двойка екзони при родственици на пациента за определяне на носителския статус в случаите, когато мутацията е известна (Тест №182).
Чувствителност на метода: зависи от съдържанието на GC и АТ, както и от наличието на сегментно дуплицирани гени.
Какво включва тестът?
· Изолиране на ДНК и съхраняване на пробата.
· Новогенерационно секвениране.
· Биоинформатичен анализ на секвенционните данни. За всеки пациент се анализират само данните за гена(ите) от интерес.
· Оформяне на писмен резултат от генетичния тест.
· Диагностична интерпретация на резултатите и генетично консултиране.
Биологичния материал: Венозна кръв или ДНК
За повече информация, моля прочете внимателно „Изисквания към биологичния материал и информация за транспортиране“.
AARS, AARS2, AASS, ABAT, ABCC8, ABCD1, ABCD3, ABCD4, ABCG5, ABCG8, ABHD12, ABHD5, ACACA, ACACB, ACAD8, ACAD9, ACADL, ACADM, ACADS, ACADSB, ACADVL, ACAT1, ACAT2, ACO2, ACOX1, ACSF3, ACSL4, ACY1, ADA, ADAMTSL2, ADAR, ADCK3, ADCY5, ADK, ADPRHL2, ADSL, AGA, AGK, AGL, AGPAT2, AGPS, AGXT, AHCY, AIFM1, AIMP1, AIMP2, AK1, AK2, AKR1D1, AKT2, ALAD, ALAS2, ALDH18A1, ALDH1A3, ALDH2, ALDH3A2, ALDH4A1, ALDH5A1, ALDH6A1, ALDH7A1, ALDOA, ALDOB, ALG1, ALG10, ALG11, ALG12, ALG13, ALG2, ALG3, ALG6, ALG8, ALG9, ALOX12B, ALPL, AMACR, AMN, AMPD1, AMPD3, AMT, ANO10, ANO5, ANTXR2, AP1S1, APOC2, APOE, APOPT1, APPL1, APRT, APTX, ARG1, ARL13B, ARL6, ARSA, ARSB, ARSG, ASAH1, ASL, ASPA, ASS1, ATIC, ATP13A2, ATP5F1A, ATP5F1D, ATP5F1E, ATP6V0A2, ATP7A, ATP7B, ATP8B1, ATPAF2, AUH, B3GALNT1, B3GALNT2, B3GALTL, B3GAT3, B3GLCT, B3GNT2, B4GALT1, B4GALT7, BAAT, BBS1, BBS10, BBS12, BBS2, BBS4, BBS5, BBS7, BBS9, BCAP31, BCKDHA, BCKDHB, BCMO1, BCS1L, BDNF, BLK, BLVRA, BMP2, BOLA3, BPGM, BSCL2, BSND, BTD, C10ORF2, C12orf65, C19orf70, C1GALT1C1, C1QBP, C7orf10, C8orf37, CA5A, CACNA1S, CAD, CANT1, CARS2, CASR, CAT, CAV1, CAV3, CBS, CC2D2A, CCDC115, CCDC28B, CD320, CEL, CEP164, CEP290, CERKL, CERS3, CFTR, CHD2, CHIT1, CHKB, CHST14, CHST3, CHST6, CHSY1, CIDEC, CISD2, CLCN1, CLCN2, CLCNKB, CLDN16, CLDN19, CLN3, CLN5, CLN6, CLN8, CLPB, CNNM2, CNNM4, COA3, COA5, COA6, COA7, COASY, COG1, COG2, COG4, COG5, COG6, COG7, COG8, COL11A2, COL2A1, COL4A1, COL4A2, COMT, COQ2, COQ4, COQ5, COQ6, COQ7, COQ8A, COQ8B, COQ9, COX10, COX14, COX15, COX20, COX6B1, COX8A, CP, CPOX, CPS1, CPT1A, CPT2, CRAT, CREBBP, CSF1R, CTC1, CTH, CTNS, CTSA, CTSC, CTSD, CTSK, CUBN, CUL4B, CYB5R3, CYC1, CYP11A1, CYP11B1, CYP11B2, CYP17A1, CYP19A1, CYP1B1, CYP21A2, CYP27A1, CYP27B1, CYP2R1, CYP2U1, CYP7B1, D2HGDH, DAO, DARS, DARS2, DBH, DBT, DCXR, DDC, DDHD1, DDOST, DECR1, DGAT1, DGKE, DGUOK, DHCR24, DHCR7, DHDDS, DHFR, DHFRL1, DHODH, DLAT, DLD, DMGDH, DNA2, DNAJC12, DNAJC19, DNAJC5, DNM1L, DNM2, DNMT1, DNMT3B, DOLK, DPAGT1, DPM1, DPM2, DPM3, DPYD, DPYS, DYM, DYRK1B, DYSF, EARS2, EBP, ECHS1, EGF, EIF2AK3, EIF2B1, EIF2B2, EIF2B3, EIF2B4, EIF2B5, ELAC2, ELOVL4, EMC1, ENO3, ENPP1, EPHX1, EPHX2, EPM2A, EPRS, ERCC6, ERCC8, ETFA, ETFB, ETFDH, ETHE1, EXT1, EXT2, FA2H, FAAH2, FAH, FAM111A, FAM126A, FARS2, FASTKD2, FBP1, FBXL4, FECH, FH, FKRP, FKTN, FLAD1, FLNA, FLNB, FMO3, FOLR1, FOLR2, FOLR3, FOXP3, FOXRED1, FTCD, FUCA1, FUT2, FUT6, FUT8, FXYD2, G6PC, G6PC3, G6PD, GAA, GABRG2, GAD1, GALC, GALE, GALK1, GALNS, GALT, GAMT, GAN, GATA6, GATM, GBA, GBA2, GBE1, GCDH, GCH1, GCK, GCLC, GCLM, GCSH, GEMIN4, GFAP, GFER, GFM1, GFM2, GFPT1, GHR, GIF, GJC2, GK, GLA, GLB1, GLDC, GLI3, GLIS3, GLRA1, GLRX5, GLUD1, GLUL, GLYCTK, GM2A, GMPPA, GMPPB, GMPS, GNAS, GNE, GNMT, GNPAT, GNPTAB, GNPTG, GNS, GOT1, GOT2, GPC3, GPD1, GPD1L, GPHN, GPI, GPIHBP1, GPT, GPX1, GRHPR, GSR, GSS, GTPBP3, GUSB, GYG1, GYS1, GYS2, H6PD, HADH, HADHA, HADHB, HAGH, HAMP, HCFC1, HEPACAM, HEXA, HEXB, HFE, HFE2, HGD, HGSNAT, HIBADH, HIBCH, HIKESHI, HK1, HLCS, HMBS, HMGCL, HMGCR, HMGCS2, HMOX1, HNF1A, HNF1B, HNF4A, HOGA1, HPD, HPRT1, HRAS, HS6ST1, HSD11B1, HSD11B2, HSD17B10, HSD17B3, HSD17B4, HSD3B2, HSD3B7, HSPD1, HTRA1, HYAL1, IBA57, IDH2, IDH3B, IDS, IDUA, IER3IP1, IFIH1, IFT172, IFT27, IMPAD1, IMPDH1, INPP5E, INPPL1, INS, INSR, ISCA1, ISCA2, ISCU, ISPD, ITPA, IVD, KARS, KCNA1, KCNJ10, KCNJ11, KCNJ2, KCNT1, KIF5A, KIF7, KLF11, KMT2A, KMT2D, L2HGDH, LAMA2, LAMP2, LARGE, LARGE1, LCAT, LCT, LDB3, LDHA, LDHB, LDLR, LDLRAP1, LEP, LEPR, LFNG, LIAS, LIPA, LIPC, LIPE, LIPT1, LIPT2, LMBRD1, LMNA, LMNB1, LPIN1, LPIN2, LPL, LRAT, LRPPRC, LTC4S, LYRM4, LYRM7, LYST, LZTFL1, MAGEL2, MAGT1, MAN1B1, MAN2B1, MANBA, MAOA, MARS2, MAT1A, MC4R, MCCC1, MCCC2, MCEE, MCOLN1, MDH2, MFF, MFN2, MFNG, MFSD8, MGAT2, MGME1, MINPP1, MIPEP, MKKS, MKS1, MLC1, MLYCD, MMAA, MMAB, MMACHC, MMADHC, MOCOS, MOCS1, MOCS2, MOGS, MPC1, MPDU1, MPI, MPV17, MRPL3, MRPL44, MRPS16, MRPS2, MRPS22, MRPS34, MRPS7, MSMO1, MTFMT, MTHFD1, MTHFR, MTHFS, MTM1, MTMR2, MTO1, MTR, MT-RNR1, MT-RNR2, MTRR, MTTP, MUT, MVK, MYH3, MYO5A, MYO7A, MYOT, NACC1, NAGA, NAGLU, NAGS, NANS, NARS2, NAT8L, NAXD, NAXE, NBAS, NDN, NDUFA1, NDUFA10, NDUFA11, NDUFA12, NDUFA13, NDUFA2, NDUFA6, NDUFA9, NDUFAF1, NDUFAF2, NDUFAF3, NDUFAF4, NDUFAF5, NDUFAF6, NDUFB11, NDUFB3, NDUFB8, NDUFB9, NDUFS1, NDUFS2, NDUFS3, NDUFS4, NDUFS6, NDUFS7, NDUFS8, NDUFV1, NDUFV2, NEU1, NEUROD1, NEUROG3, NFU1, NGLY1, NHLRC1, NIPA2, NKX6-2, NMNAT1, NNT, NOTCH3, NPC1, NPC2, NPHP1, NPHP3, NPL, NR0B2, NSD1, NSDHL, NT5C3A, NT5E, NTRK2, NUBPL, NUS1, OAT, OCLN, OCRL, OFD1, OGDH, OPA1, OPA3, OPLAH, OTC, OXCT1, PAH, PANK2, PAX4, PC, PCBD1, PCCA, PCCB, PCK1, PCK2, PCNT, PCSK1, PCSK9, PDHA1, PDHB, PDHX, PDP1, PDSS1, PDSS2, PDX1, PEPD, PET100, PEX1, PEX10, PEX11B, PEX12, PEX13, PEX14, PEX16, PEX19, PEX2, PEX26, PEX3, PEX5, PEX6, PEX7, PFKM, PGAM2, PGAP2, PGK1, PGM1, PHF6, PHGDH, PHKA1, PHKA2, PHKB, PHKG1, PHKG2, PHYH, PIGA, PIGL, PIGM, PIGN, PIGO, PIGT, PIGV, PIK3CA, PIK3R1, PIK3R2, PIK3R5, PIKFYVE, PIP5K1C, PKLR, PLA2G5, PLA2G6, PLA2G7, PLAA, PLCB1, PLCB4, PLCD1, PLCE1, PLCG2, PLEKHG2, PLIN1, PLOD1, PLOD2, PLOD3, PLP1, PMM2, PMPCA, PMPCB, PNLIP, PNMT, PNP, PNPLA2, PNPLA6, PNPO, PNPT1, POLG, POLG2, POLR1C, POLR3A, POLR3B, POLR3K, POMC, POMGNT1, POMGNT2, POMK, POMT1, POMT2, PPA2, PPARG, PPM1K, PPOX, PPT1, PRKAG2, PRKAG3, PRODH, PROM1, PRPH2, PRPS1, PSAP, PSAT1, PSPH, PTEN, PTF1A, PTGIS, PTPN11, PTRF, PTS, PUS1, PYCR1, PYCR2, PYGL, PYGM, QARS, QDPR, RAB11B, RAB23, RAI1, RARS, RARS2, RBCK1, RBSN, RDH12, RDH5, REN, REPS1, RFT1, RFX6, RHO, RLBP1, RMND1, RNASEH1, RNASEH2A, RNASEH2B, RNASEH2C, RNASET2, RPE65, RPGRIP1L, RPIA, RPS6KA3, RRM2B, RYR1, RYR3, SAMHD1, SARDH, SARS2, SAT1, SC5D, SCARB2, SCD, SCN4A, SCO1, SCO2, SCP2, SDCCAG8, SDHA, SDHAF1, SDHD, SEC23B, SENP1, SEPSECS, SERAC1, SERPINA1, SFXN4, SGSH, SI, SIM1, SLC12A3, SLC16A1, SLC16A2, SLC17A5, SLC19A2, SLC19A3, SLC1A4, SLC22A5, SLC25A1, SLC25A12, SLC25A13, SLC25A15, SLC25A19, SLC25A20, SLC25A22, SLC25A26, SLC25A3, SLC25A38, SLC25A4, SLC2A1, SLC2A2, SLC30A10, SLC33A1, SLC35A1, SLC35A2, SLC35C1, SLC36A2, SLC37A4, SLC39A4, SLC39A8, SLC3A1, SLC40A1, SLC46A1, SLC52A1, SLC52A2, SLC52A3, SLC5A1, SLC5A2, SLC6A19, SLC6A3, SLC6A8, SLC6A9, SLC7A7, SLC7A9, SLCO1B1, SLCO1B3, SMPD1, SMS, SNORD118, SOD1, SOX10, SPG11, SPG7, SPR, SPTAN1, SPTLC1, SPTLC2, SRD5A2, SRD5A3, SSR4, ST3GAL3, ST3GAL5, STAR, STN1, STS, STT3A, STT3B, SUCLA2, SUCLG1, SUCLG2, SUGCT, SUMF1, SUOX, SURF1, SYTL2, TACO1, TALDO1, TANGO2, TARS2, TAT, TAZ, TBC1D4, TBCD, TBCK, TBXAS1, TCF4, TCIRG1, TCN1, TCN2, TECR, TFAM, TFR2, TGFB1, TH, TIMM50, TIMM8A, TIMMDC1, TK2, TMEM106B, TMEM126A, TMEM126B, TMEM165, TMEM199, TMEM5, TMEM67, TMEM70, TMLHE, TOP3A, TPI1, TPK1, TPMT, TPP1, TRAPPC12, TRAPPC6B, TRAPPC9, TREH, TREM2, TREX1, TRIM32, TRIM37, TRIT1, TRMT10C, TRMT5, TRPM6, TSFM, TTC19, TTC21B, TTC8, TUBB4A, TUFM, TUSC3, TWNK, TXN2, TYMP, TYR, TYROBP, TYRP1, UBTF, UCP2, UCP3, UFC1, UFM1, UGT1A1, UMOD, UMPS, UPB1, UQCC2, UQCC3, UQCRB, UQCRC2, UQCRQ, UROC1, UROD, UROS, VARS, VARS2, VPS11, VPS13B, VPS33A, WARS2, WDPCP, WDR45, WDR45B, WFS1, XDH, YARS2, ZFP57, ZFYVE26, ZMPSTE24, ZNHIT3
