Генен панел (включва 26 генa)

Основни характеристики на клиничния фенотип

Злокачествените тумори, произхождащи от мезенхимна тъкан (включително съединителна тъкан и мускули), се наричат "саркоми". Саркомът представлява 12,6% от всички злокачествени тумори при деца и юноши под 19-годишна възраст, но рядко се среща при възрастни. Саркомите се разделят на две категории, саркоми на меките тъкани, които заемат по-голямата част от саркомите, и злокачествени първични костни тумори, които заемат приблизително 10%. Клиничната проява на саркома включва локална болка и подуване или локално зачервяване на кожата, топлина, ставен излив, болка и ограничение на дейността на крайниците или ставите и др. Етиологията на саркома е неизвестна и патогенезата е неясна. Въпреки че са относително редки, саркомите могат да се появят навсякъде в тялото и да възникнат в съединителните тъкани като кости, мускули, сухожилия, нерви, мазнини, хрущяли и кръвоносни съдове. Въпреки това се съобщава, че мутациите в някои гени са свързани с повишен риск от саркома. Този тест са включени  гени, свързани както със саркома на меките тъкани, така и с остеосаркома.

Мутациите в гените TP53, RB1, NF1, SDHA, SDHB, SDHC и SDHD често се откриват при саркоми. Туморният супресорен ген TP53 е най-честият мутирал ген при човешки рак, който също така увеличава риска от други видове рак като меланом, рак на гърдата и рак на щитовидната жлеза. При спорадични ракови заболявания, разпространението на варианти на TP53 в соматичните клетки е от 10% до 60%. p53 се инактивира поради миссенс мутацията, като по този начин унищожава пълен набор от антипролиферативни и инхибиращи растежа отговори. Протеиновият мутант p53 има канцерогенни ефекти и насърчава развитието на тумори. RB1, също тумор супресорен ген, играе основна роля в образуването на саркома. Съобщава се за значително обогатяване на патогенни вариации в ATM и ATR гени, които са свързани с отчитането на увреждане на ДНК. Мутации на зародишна линия в ензима сукцинат дехидрогеназа (SDH) на митохондриален комплекс II често се откриват в стомашно-чревни стромални тумори. В допълнение към тези гени се потвърждават неочакваните патогенни варианти в ERCC2, които могат да повлияят на свързването на ДНК, усещането за увреждане на ДНК, активността на спиралите и базалната транскрипция.

Основание за насочване/ Клинично значение:

Кандидати за този тест са всички пациенти с клинична (медицинската) или фамилна история предполагащи, че етиологията на заболяването се дължи на наследствени генетични промени. Тестът се предлага на пациенти, при които не са открити най-честите мутации, използвайки секвениране по Sanger на най-често засегнатите гени.

Това изследване специално е предвидено за анализ на наследствени герминативни мутации и не е подходящо за изследване на соматични мутации в туморна тъкан.

Пациенти с лична или фамилна анамнеза, предполагаща наследствен синдром на саркома. Важни характеристики насочващи към наследствен сарком могат да включват поява на рак преди 55-годишна възраст, повече от един първичен рак при един човек и множество засегнати хора в семейството с анамнеза за хематологични заболявания, заболявания на панкреаса, стомаха, щитовидната жлеза, мозъка, гърдата, рак на бъбреците или дебелото черво. След разглеждане на клиничната и фамилната история на пациента, това изследване може да е подходящо за някои педиатрични пациенти. Този тест е предназначен за откриване на индивиди с патогенен вариант на зародишна линия и не е валидиран за откриване на мозаицизъм под нивото от 20%. Не трябва да се изследва върху туморна тъкан.

Метод: Новогенерационно секвениране.

Методът включва двупосочно ДНК секвениране на всички кодиращи екзони и интрон-екзонни граници на прицелните гени. Лабораторията предлага Сангер-секвениране на единичен екзон или двойка екзони при родственици на пациента за определяне на носителския статус в случаите, когато мутацията е известна (Тест № 182).

Чувствителност на теста: зависи от съдържанието на GC и АТ, както и от наличието на сегментно дуплицирани гени.

Какво включва тестът?

·         Изолиране на ДНК и съхраняване на пробата.

·         Паралелно секвениране включващо двупосочно ДНК секвениране на всички кодиращи екзони и интрон-екзонни граници на прицелните гени

·         Биоинформатичен анализ на секвенционните данни. За всеки пациент се анализират само данните за гена(ите) от интерес.

·         Оформяне на писмен резултат от генетичния тест.

·         Диагностична интерпретация на резултатите и генетично консултиране.

Биологичния материал: Венозна кръв или ДНК

За повече информация, моля прочете внимателно „Изисквания към биологичния материал и информация за транспортиране“.