Тест 111.
Наследственa и спорадична несиндромна невросензорна слухова загуба

Характеристика на теста: (включва 594 гени)

Основни характеристики на клиничния фенотип

Слуховата загуба е най-честата сензорна увреда при човека. Установено е, че засяга около 5% от световната популация. Конгениталната слухова загуба е с честота 1/500 новородени. Поради голямата клинична и генетична хетерогенност, слуховата загуба може да бъде описана и категоризирана различно. Хетерогеността на слуховата загуба е поради различна етиология, различно начало, възникване преди или след проговаряне, различна клинична проява, различна тежест и различно засягане на честотите, засягане на едно или двете уши, наличие на прогресия или не, наличие или отсъствие на анатомичен дефект.

В развитите страни конгениталната (вродена) глухота се дължи 80% на генетични фактори. Наследствената слухова загуба може да бъде класифицирана като синдромна и несиндромна. Определението за несиндромна слухова загуба е слухова загуба, която не се свързва и с други симптоми. Разграничава се от синдромната слухова загуба по това, че при нея слуховата загуба е съпътствана от други симптоми на специфични синдроми. Най-често синдромите се характеризират с дисморфични промени в лицево-черепната област и/или малформации на външното ухо. Малфункции на вътрешните органи също може да са част от симптомите на синдромите. Някои от симптомите могат да бъдат едва забележими и лесно могат да бъдат пропуснати при преглед. Описани са над 400 генетични синдроми с наличие на слухова загуба. Около 60-70% от конгениталната слухова загуба е несиндромна.

Наследствената слухова загуба се унаследява автозомно доминантно, автозомно рецесивно, Х свързано или митохондриално. Слуховата загуба може да бъде свързана с невросензорен дефект или с дефект в проводимостта, или със смесена етиология. В много популации, включително и българската популация най-честата генетична причина за слухова загуба са мутации в GJB2.

Новогенерационното секвениране, анализът на панел от гени свързани с различни форми на слухова загуба помагат за откриването на генетичната причина за наблюдавания клиничен фенотип особено в случаите когато не е открита мутация в GJB2 или е открита една мутация в хеторизоготно състояние след провеждане на директно секвениране или MLPA анализ. 

Фенотипно несиндромната слухова загуба се характеризира:

-          Невросензорна слухова загуба най-често

-          Средна до тежка или пълна загуба на слуха

-          Вродена слухова загуба

-          Обикновено не прогресира

-          Засяга двете уши

Най-честите синдроми свързани със загуба на слуха:

-          Waardenburg Syndrome

-          Branchio-Oto-Renal (BOR) Syndrome

-          Neurofibromatosis Type II (NFII)

-          Stickler Syndrome

-          Treacher-Collins Syndrome

-          Usher Syndrome

-          Alport Syndrome

-          Jervell and Lange-Nielson Syndrome

-          Pendred Syndrome

-          CHARGE Syndrome

-          X-Linked Congenital Stapes Fixation with Perilymph Gusher

-          И др.

Основание за насочване:

●       За определяне на генетичната причина за възникналата синдромна или несиндромна слухова загуба, поставяне на генетична диагноза

●       За потвърждаване на диагнозата и за определяне на причината за възникналата слухова загуба (генетична или негенетична) или

●       За предсказване на отговора от провеждането на кохлеарна имплантация .

●       Наличие на несиндромна слухова загуба и отсъствие на мутации в гените, кодиращи Cx26, Cx30, Cx31 или

●       Наличие на несиндромна слухова загуба и наличие на само една рецесивна мутация в Cx26 или Cx30 или Cx31 или

●       Наличие на наследствена и/или вродена слухова загуба, но изключено митохондриално унаследяване или

●       Поставена диагноза слухова загуба и наличие на родственици със слухова загуба и с неизяснена генетична причина или

●       Наличие на родственици или деца със слухова загуба и с неизяснена генетична причина. Определяне на носителски статус с цел изчисляване риска за раждане на глухо дете или

●       За разграничаване на несиндромна от синдромна слухова загуба

 

Интерпретиране на резултатите:

·         Установяването на точкови мутации и малки делеции/инсерции в гените от панела ще позволи поставянето на генетична диагноза.

·         Наличие на големи делеции и инсерции не може да бъде установено с този метод. За установяването на такива се препоръчва комбинация с подходящ анализ за CNV (Тест №112)

·         Генетичният консултант ще интерпретира и отговори на всички въпроси относно резултата Ви.

 

Метод: Новогенерационно секвениране (NGS).

Методът включва двупосочно ДНК секвениране на всички кодиращи екзони и интрон-екзонни граници на прицелните гени. Лабораторията предлага Сангер-секвениране на единичен екзон или двойка екзони при родственици на пациента за определяне на носителския статус в случаите, когато мутацията е известна (Тест № 182).

 

Чувствителност на метода: зависи от съдържанието на GC и АТ, както и от наличието на сегментно дуплицирани гени.

 

Какво включва тестът?

●       Изолиране на ДНК и съхраняване на пробата.

●       Паралелно секвениране на прицелните гени.

●       Биоинформатичен анализ на секвенционните данни. За всеки пациент се анализират само данните за гена(ите) от интерес.

●       Оформяне на писмен резултат от генетичния тест.

●       Диагностична интерпретация на резултатите и генетично консултиране.

 

Биологичния материал: Венозна кръв, букална лигавица или ДНК

За повече информация, моля прочете внимателно „Изисквания към биологичния материал и информация за транспортиране“.


A2ML1, ABCC1, ABHD12, ABHD5, ABR, ACAN, ACOX1, ACTB, ACTG1, ADCY1, ADGRV1, AGAP1, AIFM1, ALDH1A2, ALMS1, ANKH, ANLN, AP1B1, AP1S1, AP3D1, APAF1, APOPT1, AQP4, ARSB, ARSG, ASIC5, ATF2, ATOH1, ATP1A2, ATP1A3, ATP2B2, ATP6, ATP6V0A4, ATP6V1B1, ATP6V1B2, ATP8, ATP8B1, AXIN1, BAI1, BARHL1, BBS1, BBS4, BCAP31, BCR, BCS1L, BDNF, BDP1, BLOC1S5, BLOC1S6, BMP4, BMP5, BSN, BSND, BTD, C10ORF2, CABP2, CACNA1D, CACNB2, CACNG2, CASP3, CATSPER2, CCDC50, CD151, CD164, CDC14A, CDC42, CDC6, CDH23, CDK14, CDK9, CDKN1B, CDKN1C, CDKN2D, CDT1, CEACAM16, CELSR1, CEMIP, CEP104, CEP250, CEP78, CHD7, CHRNA9, CHSY1, CIB2, CISD2, CKB, CLDN11, CLDN14, CLDN9, CLIC5, CLNS1A, CLPP, CLRN1, CNRIP1, COCH, COG4, COL11A1, COL11A2, COL1A1, COL2A1, COL4A3, COL4A4, COL4A5, COL4A6, COL9A1, COL9A2, COL9A3, COX1, COX2, COX3, CPLX1, CRYL1, CRYM, CYTB, DACT1, DCAF17, DCDC2, DCLK1, DDB2, DDR1, DFNA5, DFNB31, DFNB59, DHODH, DIABLO, DIAPH1, DIAPH3, DIO2, DIO3, DLX2, DLX5, DMD, DMXL2, DNAH2, DNAJC3, DNMT1, DPT, DSPP, DTNA, DVL1, DVL2, DVL3, ECE1, EDN3, EDNRA, EDNRB, EFTUD2, EIF3F, EIF4A3, ELMOD3, EPHB1, EPHB2, EPHB3, EPS8, EPS8L2, ERAL1, ERBB4, ERCC1, ERCC2, ERCC3, ERCC4, ERCC5, ESPN, ESR2, ESRP1, ESRRB, EVC, EXOSC2, EYA1, EYA4, GJB3, FABP4, FAM136A, FAM65B, FAS, FBXO2, FDXR, FGF10, FGF3, FGFR1, FGFR2, FGFR3, FIGN, FITM2, FKBP14, FOXC1, FOXF2, FOXG1, FOXI1, FOXI3, FRAS1, FREM2, FZD3, FZD6, GAB1, GATA3, GBX2, GDF6, GFER, GFI1, GIPC3, GJA1, GJA1P1, GJB1, GJB2, GJB4, GJB5, GJB6, GLI3, GNAI3, GPR98, GPRASP2, GPSM2, GPX1, GRAP, GREB1L, GRHL2, GRID1, GRIP1, GRM7, GRXCR1, GRXCR2, GSC, GSDME, GSTM1, GSTP1, GSTT1, GUSB, HAAO, HAL, HARS, HARS1, HARS2, HES1, HES5, HGF, HMX1, HMX2, HMX3, HOMER2, HOXA1, HOXA2, HOXB1, HSD17B4, HSPA9, HTRA2, IARS2, ICERE1, IFNLR1, IFT88, IGF1, ILDR1, ISG20, ITGA8, JAG1, JAG2, KARS, KARS1, KCNE1, KCNJ10, KCNJ16, KCNMA1, KCNQ1, KCNQ4, KDM6A, KIAA1199, KIT, KITLG, KMT2D, LAMA2, LARGE, LARGE1, LARP7, LARS2, LEMD3, LFNG, LHFPL5, LHX3, LMO4, LMX1A, LOXHD1, LOXL3, LRIG1, LRIG3, LRP2, LRTOMT, MAFB, MAN2B1, MANBA, MAP1A, MAP1B, MARVELD2, MASP1, MCM2, MCOLN3, MCPH1, MEOX1, MEPE, MET, MGP, MIR182, MIR183, miR96, MITF, MKKS, MKRN2, MN1, MORC2, MOS, MPV17, MPZL2, MRPS2, MSRB3, MSX2, MTAP, MYH14, MYH7B, MYH9, MYO15A, MYO18B, MYO1A, MYO1C, MYO1F, MYO3A, MYO6, MYO7A, NARS2, NAV2, NCOA3, ND1, ND2, ND3, ND4, ND4L, ND5, ND6, NDP, NDRG1, NEDD4, NEFH, NEU1, NEUROD1, NEUROG1, NF1, NF2, NKX3-2, NLRP3, NOG, NOTCH1, NOX3, NOXO1, NR2F1, NR4A3, NTF3, NTN1, NTN4, NTRK2, NTRK3, OC90, OFD1, OPA1, ORC1, ORC4, ORC6, OSBPL2, OTOA, OTOF, OTOG, OTOGL, OTOP1, OTOR, OTX1, OTX2, P2RX2, PAX2, PAX3, PCDH15, PCDH20, PCGF2, PDE1C, PDSS1, PDZD7, PET100, PEX1, PEX10, PEX11B, PEX12, PEX13, PEX14, PEX16, PEX19, PEX2, PEX26, PEX3, PEX5, PEX6, PEX7, PHEX, PHF20, PHYH, PIK3C2A, PIP4P1, PISD, PITX2, PJVK, PLCB4, PLEK, PLS1, PLS3, PMP22, PNOC, PNPT1, POLD1, POLH, POLR1A, POLR1C, POLR1D, PORCN, POU1F1, POU3F4, POU4F3, PPIP5K2, PPP3R1, PRKCB, PROP1, PRPS1, PRRX1, PRRX2, PSIP1, PTK7, PTPRQ, PTPRS, RAI1, RARA, RARB, RARG, RASA1, RDX, REEP6, REST, RIPOR2, RMND1, RNR1, ROR1, RPGR, RPS28, RPS6KA3, S1PR2, SALL1, SALL4, SCARB2, SCD5, SCRIB, SDHD, SEMA3D, SEMA3E, SERAC1, SERPINB6, SETD5, SF3B4, SGO2, SGOL2, SGPL1, SH3TC2, SIK3, SIX1, SIX2, SIX5, SLC12A1, SLC12A2, SLC12A6, SLC12A7, SLC17A8, SLC19A2, SLC1A3, SLC22A4, SLC26A4, SLC26A5, SLC28A3, SLC29A3, SLC30A4, SLC33A1, SLC44A2, SLC44A4, SLC4A11, SLC4A7, SLC52A2, SLC52A3, SLC9A1, SLITRK6, SMAD4, SMPX, SMS, SNAI2, SOBP, SOD1, SOX10, SOX2, SOX9, SPATA5, SPATC1L, SPINK5, SPNS2, SPRY2, SPTBN4, ST3GAL5, STAG2, STRC, STRN, SUCLA2, SUCLG1, SYNE4, SYNJ2, SYT2, TBC1D24, TBL1X, TBX1, TBX10, TCF21, TCOF1, TECTA, TFAP2A, TFCP2, TGFA, TGFB2, THOC1, THRA, THRB, TIMM8A, TJP2, TMC1, TMEM126A, TMEM132E, TMEM55B, TMIE, TMPRSS3, TMPRSS5, TMTC2, TNC, TNFRSF11B, TOP2B, TPRN, TRAM2, TRIOBP, TRMT10C, TRMU, TRNA, TRNg, TRNH, TRNI, TRNL1, TRNL2, TRNM, TRNP, TRNQ, TRNR, TRNS1, TRNS2, TRNT, TRNV, TRNW, TRNY, TRPV4, TRRAP, TSHR, TSHZ1, TSPEAR, TUB, TUBB4B, TWNK, TWSG1, TYR, TYRP1, UBR1, UCN, USH1C, USH1G, USH2A, USP48, VANGL2, VCAN, WBP2, WFS1, WHRN, WIF1, XPA, XPC, XYLT2, YAP1, YARS, ZAN, ZNF469
Срок за изпълнение:
50 работни дни