Генен панел: (включва 2 генa)
ALK и PHOX2B
Основни характеристики на клиничния фенотип
По-голямата част от педиатричните ракови заболявания са спорадични; въпреки това се смята, че 5%-10% се дължат на наследствена предразположеност. Разстройствата, представени на този панел, обикновено са de novo или се унаследяват по автозомно-доминантен начин, с изключение на синдрома на мозаечната пъстра анеуплоидия (автозомно-рецесивен).
Този тест изследва гените ALK и PHOX2B, които са свързани с фамилния невробластом. Това състояние води до повишен риск от развитие на злокачествени или доброкачествени тумори, които произхождат от невробласти. Такива тумори най-често се развиват в надбъбречната жлеза, корема, гърдите, шията и таза.
Генетичното изследване на тези гени може да потвърди диагнозата и да помогне при вземането на решения за лечение. Идентифицирането на вариант, причиняващ заболяване, също би насочило тестването и диагностицирането на рискови роднини. Този тест е специално предназначен за наследствени мутации на зародишната линия и не е подходящ за откриване на соматични мутации в туморна тъкан.
Основание за насочване/ Клинично значение:
Кандидати за този тест са всички пациенти с мултифокални, рекурентни, и ранно възникнали (т.е. преди 50 годишна възраст) колоректални тумори или с фамилна история на колоректален карцином, но без данни за наличие на родственици с ФАП. Герминативни мутации в гените асоцииращи се със синдрома на Линч са свързани и с овариалния карцином.
Това изследване специално е предвидено за анализ на наследствени герминативни мутации и не е подходящо за изследване на соматични мутации в туморна тъкан.
Метод: Новогенерационно секвениране.
Методът включва двупосочно ДНК секвениране на всички кодиращи екзони и интрон-екзонни граници на прицелните гени. Лабораторията предлага Сангер-секвениране на единичен екзон или двойка екзони при родственици на пациента за определяне на носителския статус в случаите, когато мутацията е известна (Тест № 182).
Чувствителност на теста: зависи от съдържанието на GC и АТ, както и от наличието на сегментно дуплицирани гени.
Какво включва тестът?
· Изолиране на ДНК и съхраняване на пробата.
· Паралелно секвениране включващо двупосочно ДНК секвениране на всички кодиращи екзони и интрон-екзонни граници на прицелните гени
· Биоинформатичен анализ на секвенционните данни. За всеки пациент се анализират само данните за гена(ите) от интерес.
· Оформяне на писмен резултат от генетичния тест.
· Диагностична интерпретация на резултатите и генетично консултиране.
Биологичния материал: Венозна кръв или ДНК
За повече информация, моля прочете внимателно „Изисквания към биологичния материал и информация за транспортиране“.