Генен панел (включва 16 генa)

PTCH1, PTCH2,SUFU, TP53, MLH1, MSH2, MSH6, PMS1, PMS2, APC, BRCA2, PALB2, GPR161, ELP1, CREBBP, EP300

Основни характеристики на клиничния фенотип

Медулобластомът е първичен злокачествен тумор на централната нервна система (ЦНС), който се наблюдава по-често при деца, тъй като засяга приблизително 9,6 деца и 0,54 възрастни на милион индивида. Също така се съобщава по-често при мъже, отколкото при жени. Туморът вузниква в мозъка, в основата на черепа (задната ямка) и има тенденция да се разпространява в други области на мозъка и гръбначния мозък. Хората с медулобластом могат да имат проблеми с ходенето, баланса, фините двигателни умения, главоболие, гадене, гърчове и други характеристики. Лечението обикновено се състои от операция за отстраняване на възможно най-голяма част от тумора и последващо лечение с радиация и/или химиотерапия, което води до подобрена прогноза и повишено наблюдение.

Повечето случаи на медулобластом се смятат за спорадични и са стратифицирани в молекулярни подгрупи в зависимост от основната биология и клиничните характеристики на пациента. Групите най-често се разделят на такива засягащи WNT пътя [WNT група], SHH пътя [SHH група], група 3 и група 4. Въпреки това има също данни за асоциирането на медулобластоми с наличие на генетични синдроми като синдром на Gorlin, синдром на Li-Fraumeni, анемия на Fanconi, фамилна аденоматозна полипоза (FAP) и други. Гените, свързани с тези заболявания, са туморсупресорни и мутациите в тях често водят до загуба на функциониращи белтъци, както и  missense варианти и промяна в броя копия. Тези варианти могат да бъдат както унаследени, така могат да възникнат и като de novo.

Смята се, че патогенните варианти в гените от този панел са отговорни за приблизително 5% от случайте на медулобластом.

Основание за насочване/ Клинично значение:

Кандидати за този тест са всички пациенти с клинична (медицинската) или фамилна история предполагащи, че етиологията на заболяването се дължи на наследствени генетични промени. Тестът се предлага на пациенти, при които не са открити най-честите мутации, използвайки секвениране по Sanger на най-често засегнатите гени.

Това изследване специално е предвидено за анализ на наследствени герминативни мутации и не е подходящо за изследване на соматични мутации в туморна тъкан.

Метод: Новогенерационно секвениране.

Методът включва двупосочно ДНК секвениране на всички кодиращи екзони и интрон-екзонни граници на прицелните гени. Лабораторията предлага Сангер-секвениране на единичен екзон или двойка екзони при родственици на пациента за определяне на носителския статус в случаите, когато мутацията е известна (Тест № 182).

Чувствителност на теста: зависи от съдържанието на GC и АТ, както и от наличието на сегментно дуплицирани гени.

Какво включва тестът?

·         Изолиране на ДНК и съхраняване на пробата.

·         Паралелно секвениране включващо двупосочно ДНК секвениране на всички кодиращи екзони и интрон-екзонни граници на прицелните гени

·         Биоинформатичен анализ на секвенционните данни. За всеки пациент се анализират само данните за гена(ите) от интерес.

·         Оформяне на писмен резултат от генетичния тест.

·         Диагностична интерпретация на резултатите и генетично консултиране.

Биологичния материал: Венозна кръв или ДНК

За повече информация, моля прочете внимателно „Изисквания към биологичния материал и информация за транспортиране“.