Характеристика на теста:
APC (OMIM # 611731) - 5q22.2, точкови мутации в ген MUTYH (OMIM #604933; c.536A>G, p.Tyr179Cys и c.1187G>A, p.Gly396Asp) - 1p34.1
Основни характеристики на клиничния фенотип:
Наследствена Аденоматозна Полипоза (FAP; OMIM #175100) е наследствен раков синдром клинично характеризиращ се с развитие в колона или ректума на стотици до хиляди полипи. При липса на лечение почти всички пациенти с FAP до достигане на 40 годишна възраст развиват колоректален карцином. Освен това пациентите с FAP имат предразположение за развитие на десмоидални тумори, рак на тънките черва, тироиден карцином, хепатобластома и медулобластома.
FAP е автозомно-доминантно заболяване в резултат на герминативна мутация в Adenomatous Polyposis Coli (APC) гена. Герминативните мутации са локализирани в кодиращите райони на гена. Класическата (остра) форма на FAP (развиващи над 1000 колоректални полипа) обикновено се наблюдава при пациенти, притежаващи мутации в кодоните от 1250 до 1464. В контраст, при пациенти с АFAP (attenuated FAP т.е. развиващи по-малко от 100 колоректални полипа) обикновенно се характеризират с мутации в самото начало (5’ край) и в самия край (3’ край) на гена, или в алтернативен сплайс вариант на екзон 9. Повече от 1 700 герминативни мутации са открити в APC гени и 85 - 90% са nonsense или frameshift мутации, които водят до функционално неактивен белтъчен продукт. Останалите 10 – 15% се дължат на големи делеции и дупликации.
В приблизително 20% от класическите FAP и около 70-80% от AFAP случаите не се откриват APC/MUTYH точкови мутации.
Основание за насочване / Клинично значение:
За изследване на големи делеции/ дупликации пренареждания в APC гена се насочват пациенти с диагноза Наследствена Аденоматозна Полипоза (FAP), изследвани и без открита мутация в гена APC или близки родственици на пациенти, при които е открита аберация в APC гена. Този анализ е създаден за изследване на герминативни мутации и не е подходящ за изследване на соматични мутации в туморна тъкан.
Интерпретиране на резултатите:
· Установяването на делеции/дуплкации пренареждания в гена APC позволява поставянето на диагноза Наследствена Аденоматозна Полипоза (FAP).
· Генетичният консултант ще интерпретира и отговори на всички въпроси относно резултата Ви.
Метод: MLPA (Мултиплексна лигазно-зависима амплификация)
MLPA е полуколичествен метод за определяне на брой копия от ДНК. Методиката се използва за откриване на вътрегенни или цялостногенни делеции или дупликации. Анализът за търсене на големи делеции/дупликации се извършва с помощта на наборът SALSA MLPA P043 APC на MRC-Holland (Amsterdam, Holland).
Чувствителност на теста: 90%
Какво включва тестът?
· Изолиране на ДНК и съхраняване на пробата.
· MLPA за откриване на делеции/дупликации, които засягат генa APC.
· MLPA сонди за наличие на конкретни познати точкови мутации в генa MUTYH (c.536A>G, p.Tyr179Cys и c.1187G>A, p.Gly396Asp).
· Оформяне на писмен резултат от генетичния тест.
· Диагностична интерпретация на резултатите и генетично консултиране.
Биологичния материал: Свеж или FFPE туморен материал, или ДНК изолирана от Свеж или FFPE туморен материал.
За повече информация, моля прочете внимателно „Изисквания към биологичния материал и информация за транспортиране“.
