Тест 205.
Биоинформатичен анализ и интерпретация на данни от NGS

Характеристика на теста:

Лабораторията предлага биоинформатичен анализ и диагностична интерпретация на данните, получени от NGS.

Какво включва тестът? 

  • Биоинформатичен анализ на секвенционните данни. За всеки пациент се анализират само данните за гена(ите) от интерес.

    • Оценка на качеството.

    • Откриване на генетични варианти.

    • Анотация на открити варианти.

    • Оценка на ефекта на непознати/варианти с недостатъчна анотация

    • Ранкиране на откритите варианти според патогенност/релевантност към конкретния случай.

  • Оформяне на писмен резултат от анализа. 

За извършване на анализа се изискват:

  • bam файлове

Какво включва услугата?

  • (при нужда) Биоинформатична анотация на резултатите.

    • Анотация на открити варианти.

    • Оценка на ефекта на непознати/варианти с недостатъчна анотация

    • Оценяване на откритите варианти според патогенност/релевантност към конкретния случай, използвайки ACMG критериите.

    • Оформяне на писмен резултат от анализа.

  • Диагностична интерпретация на резултатите и генетично консултиране.

За извършване на анализа се изискват:

  • Данни за позициите и вида на откритите варианти (тип нуклеотидни/аминокиселинни замени)

Диагностична интерпретация на данни от секвениране

След извършване на биоинформатичния анализ резултатите трябва да бъдат интерпретирани от специалист - генетичен консултант. При наличие на обработени резултати от предварително извършено секвениране може да се пристъпи направо към тази стъпка, като е възможно да бъде допълнена предварително наличната информация ако има липса на важни за интерпретацията данни.


Срок за изпълнение:
40 работни дни